南方医科大学图书馆随学校创办而诞生、随学校的变迁而变迁，历次更名为：1951年东北军区军医学校图书室、第十一军医中学图书室、第十一军医学校图书室，1958年齐齐哈尔医学院图书馆，1962年解放军齐齐哈尔医学院图书馆，1965年齐齐哈尔军医学院图书馆，1966年中国人民解放军医学院图书馆，1975年第一军医大学图书馆。2004年8月随学校整体转制，改为现名南方医科大学图书馆。 　　南方医科大学图书馆秉承“资源、服务、管理、技术”四位一体的发展模式，是教育部科技查新工作站（Y01）、广东省高等学校数字化文献资源共享服务体系六个资源中心之一——医学数字资源中心和广东省高等学校图书情报工作指导委员会服务创新委员会的主任委员单位。包括校本部和顺德两个馆区，总建筑面积44，661平方米；图书馆现有工作人员40人，下设学习支持部、文献采编部、参考咨询部、综合业务部、决策信息部、知识产权信息服务部和医学情报学教研室六部一室；馆领导2人，其中馆长兼党支部书记1人，副馆长1人。